GPU技术大会：天河一号分子动力学应用

　　【现场报道】GPU技术大会亚洲站(GTC Asia)于2011年12月14-15日在北京国家会议中心隆重召开，这也是GPU技术大会首次登陆中国。作为业界最大的技术盛会，GPU技术大会旨在分享GPU给科学和计算带来的变革性的影响。在GPU技术大会亚洲站上，来自顶尖科学研究机构的科学家们将参与到一系列演讲、技术分享会、辅导课程、小组论坛和圆桌讨论会中，探讨GPU如何改变高性能计算(HPC)行业以及GPU如何帮助加速解决学者、研究人员、科学家以及开发者所面临的复杂计算难题。

▲中国科学院过程工程研究所博士侯超峰

　　在12月14日举办的百亿亿次(ExaScale)研讨会上，全球高性能计算的顶尖专家分享Exascale超级计算的最新研究成果，共同探讨由Exascale超级计算所能实现的结构性的研究方法，以及挑战和机遇。中国科学院过程工程研究所博士侯超峰发表了“基于天河一号千万亿次分子动力学晶体硅模拟” 的演讲，分享了天河一号二期(天河-1A)在分子动力学的应用。

　　众所周知，硅具有半导体性质，是重要的半导体原材料。侯超峰介绍基于天河一号对晶体硅的模拟主要出于三个目的，首先分析硅材料属性和导电性以及晶体硅中的缺陷，其次研究其化学结构，以及其中有多少个原子和纳米级成分，最后硅纳米线光应用与传感器应用。

▲天河一号

　　天河一号配备了7168个NVIDIA Tesla M2050 GPU、86106颗智强5670处理器，升级后的峰值达到了4.7Pflops。

　　侯超峰表示，在晶体硅的原子模拟方面，侧重于四大方面，分别是分子动力学、大规模大尺度的模拟以及算法、采用GPU和CPU的混合模型、具备潜在应用。

▲模拟框架

　　目前模拟框架主要应用于大规模外相模拟和表面的重建。基于天河一号，外相模拟方面主要基于GPU完成，可实现1.87Pflops的计算峰值，在表面的重建模拟方面依靠于GPU和CPU共同完成，分别可实现1.17Pflops和92.1Tflops的计算峰值。

　　了解更多详情可浏览2011GTC大会专题。

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（编辑：ASP站长网）